Vikingská DNA pomáhá odhalit, když se objevila mutace genů boje proti HIV: před 9 000 lety poblíž Černého moře
Nová studie tisíců tisíců genomů pomáhá chránit lidi před infekcí HIV, která pravděpodobně pochází u lidí, kteří žili v průběhu času mezi dobou kamenné a vikingský věk.
„Ukazuje se, že varianta vznikla u jednoho jednotlivce, který žil v oblasti poblíž Černého moře mezi 6 700 a 9 000 lety,“ Simon RasmussenOdborník na bioinformatiku na University of Copenhagen a autor ko-senior studie uvedl v a prohlášení. Varianta musela být v minulosti užitečná pro něco jiného, protože HIV u lidí je Méně než století staré.
Ve studii zveřejněné 5. května v časopise BuňkaRasmussen a jeho kolegové podrobně popsali jejich hledání původu genetické mutace známé jako CCR5 Delta 32. CCR5 je protein převážně nalezený v imunitních buňkách, které mnoho – ale ne všechny – kmeny HIV používají k vloupání do těchto buněk a spouštění infekce.
Ale u lidí se dvěma kopiemi mutace CCR5 Delta 32 se protein deaktivuje a v podstatě „uzamkne“ virus HIV. Vědci tuto mutaci využili Vyléčte hrst lidí z HIV.
Související: Záhadný případ „Ženevského pacienta“, nejnovější osoba v dlouhodobé remisi z HIV, vyvolává otázky
Vědci se dozvěděli, že tato varianta tvoří 10% až 16% genů CCR5 pozorovaných v evropských populacích. Pokusy o identifikaci jeho původu a sledování jeho šíření však dříve objevily krátké, protože starověké genomy jsou často extrémně fragmentární.
V nové studii výzkumný tým identifikoval mutaci ve 2 504 genomech od moderních lidí vzorkovaných pro projekt 1000 genomů, mezinárodní úsilí katalogizovat lidské genetické variace. Poté vytvořili model pro vyhledávání 934 starověkých genomů z různých oblastí Eurasie od raného mezolitického období po Vikingský věkod zhruba 8000 př.nl do 1 000 AD.
„Při pohledu na tento velký datový soubor můžeme určit, kde a kdy vznikla mutace,“ spoluautor studie Kirstine RavnVe svém prohlášení uvedl výzkumník na Kodaňské univerzitě.
Genetické detektivní dílo týmu odhalilo, že osoba, která tuto mutaci poprvé nesla, žila poblíž Černého moře kolem roku 7000 př.nl, po celou dobu Do Evropy dorazili rané zemědělci přes západní Asii. Vědci také zjistili, že prevalence mutace explodovala mezi 8 000 a 2 000 lety, což naznačuje, že to bylo nesmírně užitečné, když se lidé odstěhovali z euroasijské steppe.
Zjištění studie jsou v rozporu s předchozími předpoklady, že mutace se objevila nedávno. Například to znamená, že zvýšení frekvence mutace nevyplývalo ze středověkých ran ani z průzkumu Vikingů, což mohlo zavést tlak na imunitní buňky lidí.
Když není HIV vypleněn, protein CCR5 pomáhá kontrolovat, jak imunitní buňky reagovat na signály zvané chemokinyPravděpodobně pomáhá nasměrovat buňky místa zánětu v těle.
Vědci naznačují, že lidé, kteří nesli speciální variantu CCR5, měli výhodu. „Lidé s touto mutací byli lepší v přežití, pravděpodobně proto, že to tlumilo Imunitní systém v době, kdy byli lidé vystaveni novým patogenům, “spoluautor studie Leonardo CobuccioVe svém prohlášení uvedl v Kodaňské univerzitě postdoktorand na Kodaňské univerzitě. I když to zní negativně, příliš agresivní imunitní systém může být smrtící, řekl – když čelíte novým bakteriím, chcete jen dost imunitní reakce podmanit hrozbu, aniž by to zranilo samotné tělo.
„Jak lidé přecházeli z hladu-sběračů na žijící v zemědělských společnostech,“ řekl Cobuccio, „zvýšil se tlak z infekčních chorob a vyváženější imunitní systém mohl být výhodnější.“ Toto je samozřejmě hypotéza; Přesné tlaky, které vedou ke zvýšení varianty, nejsou jisté.
