Oznámení nové publikace pro článek pro Zooses časopis. Tato studie byla zaměřena na analýzu patogenních charakteristik Bordetella Hinzii (B. Hinzii) a objasnění mechanismů rezistence na antibiotiku, distribuci genů virulence a potenciál vývoje vakcíny.
Z databáze NCBI byly staženy genomy 38 globálních kmenů. Po kontrole kvality s checkM byla provedena analýza pánve-genomu s Roary, fylogenetické stromy založené na SNP byly konstruovány s úbočí a Antibiotická rezistence Geny (databáze karty) a geny virulence (databáze VFDB) byly předpovězeny s ABRICATE. Nástroje pro bioinformatiky byly integrovány do proteinů vakcíny proti obrazovce.
Všechny kmeny nesly geny vnitřní rezistence, včetně efluxních čerpadel (Mexab-Oprm) a β-laktamáza HBL-1což umožnilo rezistenci deseti třídám antibiotik. Jádro virulenční geny (BPLA-L, Bvgasa geny spojené s bičíky) byly vysoce konzervované (rychlost detekce> 92,1%). Analýza SNP klasifikovala kmeny na šest kmenů a izoláty odvozené od člověka vykazovaly shlukování specifické pro hostitele. Genom pánve byl otevřený (7 530 genů; Parametr zákona Heaps B = 0,35). Dva proteiny vnější membrány, LPTD a BAMD, byly identifikovány jako kandidáti na vakcíny (skóre antigenicity> 0,4; žádná hostitelská homologie).
B. Hinzii Vykazuje přenosová rizika mezi hostitelem, řízená konzervovanými virulenčními geny a otevřeným genomem umožňujícím adaptivní vývoj. LPTD a BAMD představují potenciální cíle vakcíny vyžadující další ověření. Tato studie poskytuje teoretický základ pro strategie klinického řízení a prevence.
Zdroj:
Reference časopisu:
Rui, J., et al. (2025). Genomické charakteristiky Bordetella Hinzii a objev cíle vakcíny. Zooses. doi.org/10.15212/ZOONSOSS-2025-0027.
