Některé závažné plísňové infekce se vyskytují v oblastech Spojených států se specifickým prostředím a jsou často spojeny s expozicí půdy. Tyto infekce mohou postihnout zdravé i imunokompromitované lidi, ale správná diagnóza zůstává pomalá, což zdržuje léčbu.
Současný zlatý standard pro stanovení diagnózy se opírá o kultivaci plísní, která může trvat týdny, a testy, které hledají antigeny, které postrádají specifitu, nebo protilátky v krvi, které jsou v časném stádiu onemocnění často nespolehlivé. Nyní však vědci z Indiana University Health a IU School of Medicine vyvinuli nový molekulární test schopný detekovat tři hlavní patogenní houby najednou – a s mnohem rychlejším obratem než tradiční metody.
Práce bude představena na výročním zasedání a výstavě Expo Asociace pro molekulární patologii (AMP) 2025, které se bude konat 11.–15. listopadu v Bostonu.
Dr. Kenneth Gavina, Ph.D., je ředitelem klinické mikrobiologie v Eskanazi Health v Indianapolis. Dohlížel na projekt prostřednictvím lékařské fakulty Indiana University. Jeho tým se snažil identifikovat tři plísňové infekce, které každoročně postihují tisíce lidí, jsou často mylně považovány za jiná respirační onemocnění a mohou být život ohrožující, zejména u lidí s oslabenou imunitou:
- Histoplazmóza se obvykle projevuje jako plicní infekce u pacientů, kteří vdechli půdu obsahující ptačí nebo netopýří trus. Nejčastěji se vyskytuje v údolích řek Ohio a Mississippi.
- Blastomykóza projevuje se také jako plicní infekce, ale může také progredovat a postihovat kůži, kosti a další orgány. Vyskytuje se hlavně ve střední a jihovýchodní části USA
- Kokcidioidomykóza je běžně známá jako údolní horečka. Ačkoli většina těchto plicních infekcí je mírná, u některých pacientů se rozvine těžký zápal plic nebo se u nich objeví infekce jinde v těle. Vyskytuje se především v jihozápadních státech, včetně Arizony, Kalifornie a Nového Mexika.
Výzkumníci navrhli multiplexní test PCR v reálném čase, což znamená, že dokáže detekovat více patogenů současně ze stejného vzorku.
Jejich test se zaměřil na tři genetické oblasti, které jsou jedinečné pro každou houbu: ITS1 for HistoplasmaBAD1 pro Blastomycesa gen A2/PRA pro Coccidioides. Přímou detekcí genetického materiálu hub obchází PCR test pomalý kultivační proces, který je komplikován schopností hub přecházet mezi environmentálními a lidskými formami.
Když porovnali své výsledky PCR se standardními laboratorními metodami, PCR test identifikoval všechny testované vzorky se 100% přesností. Navíc byl 100% specifický, to znamená, že omylem nezjistil jiné houby nebo kontaminanty.
Pracovní postup také eliminuje potřebu časově náročných kroků extrakce DNA, což potenciálně snižuje dobu obratu a laboratorní riziko spojené s manipulací s živými patogenními houbami.
Náš test má potenciál výrazně zlepšit dobu obratu a diagnostickou jistotu u infekcí, které bylo historicky obtížné rychle detekovat.“
Dr. Kenneth Gavina, Ph.D., ředitel klinické mikrobiologie, Eskanazi Health, Indianapolis
Důležité je, že systém týmu běží na platformě, která se již používá v mnoha klinických laboratořích, což jej činí potenciálně docela dostupným.
„Zatímco probíhá další klinické ověřování, tento test ukazuje silný potenciál vyplnit velkou mezeru v diagnostice hub,“ řekl Gavina. Test má schopnost detekovat tři hlavní příčiny endemických mykóz ve Spojených státech přímo z klinických vzorků nebo může být použit jako forma definitivní identifikace z houbové kultury. „Klinici v současné době nemají žádné molekulární testy schválené FDA na tyto tři patogeny, takže rychlá a spolehlivá detekce je naléhavou potřebou.“
Na tuto práci dohlížel Dr. Kenneth Gavina, Ph.D., odborný asistent klinické patologie a laboratorní medicíny na IU School of Medicine, a bude představena jedna z lékařských laboratorních vědkyň na IU Health, Kylee Alexander, během posterové sekce v 9:15 v pátek 14. listopadu v Thomas M. Menino Convention and Exhibition Center v Bostonu. Alexanderovo číslo plakátu je ID008. Gavina bude k dispozici pro diskusi o práci s reportéry.
