Starověké genomy odhalují původ lidského herpesviru z doby železné 6

Vědci poprvé zrekonstruovali starověké genomy lidského betaherpesviru 6A a 6B (HHV-6A/B) z archeologických lidských pozůstatků starých více než dvě tisíciletí. Studie vedená Vídeňskou univerzitou a Univerzitou v Tartu (Estonsko) a publikovaná v Science Advances, potvrzuje, že tyto viry se vyvíjely s lidmi a uvnitř lidí přinejmenším od doby železné. Zjištění sledují dlouhou historii integrace HHV-6 do lidských chromozomů a naznačují, že HHV-6A tuto schopnost brzy ztratil.

HHV-6B infikuje asi 90 procent dětí ve věku dvou let a je nejlépe známý jako příčina roseola infantum – neboli „šesté nemoci“ – hlavní příčiny febrilních křečí u malých dětí. Spolu se svým blízkým příbuzným HHV-6A patří do skupiny široce rozšířených lidských herpesvirů, které typicky vyvolávají celoživotní latentní infekce po počátečním mírném onemocnění v raném dětství. To, co je dělá výjimečnými, je jejich schopnost integrovat se do lidských chromozomů – tato vlastnost umožňuje viru zůstat nečinný a ve vzácných případech zdědit jako součást vlastního genomu hostitele. Takové zděděné virové kopie se dnes vyskytují zhruba u jednoho procenta lidí. Zatímco dřívější studie předpokládaly, že tyto integrace byly staré, nová data z této studie poskytují první přímý genomický důkaz.

Obnovení virové DNA z dávné minulosti

Mezinárodní výzkumný tým vedený Vídeňskou univerzitou a Univerzitou v Tartu (Estonsko) – ve spolupráci s University of Cambridge a University College London – prověřil téměř 4000 vzorků lidských koster z archeologických nalezišť po celé Evropě. Bylo identifikováno a rekonstruováno jedenáct starověkých virových genomů – nejstarší od mladé dívky z doby železné v Itálii (1100–600 př. n. l.). Zbývající jedinci pokrývali široký geografický a časový rozsah: Oba typy HHV byly nalezeny ve středověké Anglii, Belgii a Estonsku, zatímco HHV-6B se objevil také ve vzorcích z Itálie a raně historického Ruska. Několik anglických jedinců neslo zděděné formy HHV-6B, což z nich činí nejstarší známé přenašeče chromozomálně integrovaných lidských herpesvirů. Belgické naleziště Sint-Truiden přineslo největší počet případů, přičemž oba virové druhy cirkulovaly ve stejné populaci.

Zatímco HHV-6 v určité fázi života infikuje téměř 90 % lidské populace, pouze asi 1 % přenáší virus, který byl zděděn od vašich rodičů, ve všech buňkách svého těla. Těchto 1 % případů je to, co s největší pravděpodobností identifikujeme pomocí starověké DNA, což ztěžuje hledání virových sekvencí. Na základě našich údajů lze nyní sledovat vývoj virů v průběhu více než 2 500 let v celé Evropě pomocí genomů od 8. do 6. století před naším letopočtem až do současnosti.“

Meriam Guellil, vedoucí výzkumník studie, Katedra evoluční antropologie, Vídeňská univerzita

Dávné integrace, trvalé následky

Získané genomy umožnily vědcům určit, kde v chromozomech se viry integrovaly. Srovnání s moderními daty odhalilo, že k některým integracím došlo před velmi dlouhou dobou a předávaly se z generace na generaci po tisíciletí. Zdá se, že jeden ze dvou virových druhů (HHV-6A) postupem času ztratil svou schopnost integrovat se do lidské DNA – důkaz, že tyto viry se vyvíjely odlišně, zatímco koexistovaly se svými lidskými hostiteli.

„Nošení kopie HHV6B ve vašem genomu bylo spojeno s angínou – srdečním onemocněním,“ říká Charlotte Houldcroft (Department of Genetics, University of Cambridge). „Víme, že tyto zděděné formy HHV6A a B jsou dnes ve Spojeném království běžnější ve srovnání se zbytkem Evropy, a toto je první důkaz o dávných nosičích z Británie.“

Nová kapitola ve vývoji viru a hostitele

Objev těchto starověkých genomů HHV-6 poskytuje první časově označený důkaz o dlouhodobé společné evoluci tohoto viru s lidmi na genomické úrovni. Ukazuje také, jak může starověká DNA odhalit dlouhodobý vývoj infekčních chorob – od krátkodobých dětských infekcí až po virové sekvence, které se staly součástí lidského genomu. HHV-6A a HHV-6B, objevené teprve v 80. letech 20. století, lze nyní vysledovat až do doby železné a nabízejí přímé genomové důkazy pro starou, sdílenou historii mezi viry a lidmi. „Moderní genetická data naznačují, že HHV-6 se mohl vyvíjet s lidmi od naší migrace z Afriky,“ říká Guellil. „Tyto starověké genomy nyní poskytují první konkrétní důkaz jejich přítomnosti v hluboké lidské minulosti.“