Test RT-Lamp je molekulární test s vysokou citlivostí a specificitou | Foto kredit: CDC/ Ray Butler, MS
Vědci v Thiruvananthapuramu založeném na Sree Chitra Tirunal Institute for Medical Sciences and Technology (SCTIMST) vyvinuli a testovali nový, nákladově efektivní test, v reálném čase (RT-LAMP) pro včasnou diagnózu TB. Podobně jako Genexpert a Truenat, i test RT-lamp je molekulární test s vysokou citlivostí a specificitou. Test RT-Lamp byl schopen detekovat TB DNA, i když na mikrolitru bylo přítomno pouze 10 čísel kopírování.
Hlavním handicapem, který zabránil dosud používání lampy pro diagnostiku TB, byla neschopnost používat jakékoli barvivo, protože barviva obecně inhibují reakci vedoucí k falešným negativům. Vědci na SCTIMST překonali tuto výzvu tím, že se obrátili na fluorescenční barvivo SYTO 16, které se běžně používá v laboratořích pro studium buněk a dalších biologických vzorků. A na rozdíl od RT-PCR, které vyžadují tři různé nastavení teploty k dokončení testu, test RT-Lamp pracuje při jedné teplotě. Protože se používá fluorescenční barvivo, může být amplifikace měřena na konci běhu, ale každou minutu.
„Se šesti primery používanými pro amplifikaci ve srovnání se dvěma v případě RT-PCR je rychlost amplifikace vysoká, a proto lze výsledky pozitivních vzorků získat za 10-20 minut,“ říká Dr. Anoopkumar Thekkuveettil od Sctimst a odpovídajícím autorem příspěvku zveřejněného v příspěvku v příspěvku v příspěvku Vědecké zprávy. „Protože všech šest primerů se musí vázat na DNA pro začátek amplifikace, test RT-Lamp má velmi vysokou specificitu.“ Protože se na rozdíl od testů RT-PCR nepoužívá žádná sonda, a protože barvivo a primery jsou levné, test RT-lamp se stává vysoce cenově dostupným.
Test byl testován na 350 presumptivních vzorcích sputum plicního TB. Sada RT-Lamp byla vyhodnocena na mikrobiologickém referenčním standardu (MRS), Genexpert a testu séru. Studie byla provedena od října 2019 do března 2020 a od ledna 2023 do března 2024. Test RT-Lamp prokázal mírně vyšší citlivost a specificitu než test Genexpert. Ve srovnání s MRS vykazovala RT-lamp citlivost 89,36% a 94,06% specificitu.
„Souprava testu RT-lamp byla vyvinuta jako systém otevřené platformy, který umožňuje repetici existujících strojů RT-PCR pro diagnostiku TB. „Je možné zpracovat až 96 nebo 384 testů v jednom běhu. Test tedy usnadňuje testování s vysokou propustností, což umožňuje zpracování velkého počtu vzorků pacienta v jednom běhu.“
„Technologie byla licencována pro průmysl, obdržela schválení od CDSCO a v současné době je ověřena společností ICMR. Program WHO HEALTIOL Access Pool Pool v současné době hodnotí technologii a čeká na ověření ICMR,“ říká.
S téměř 79% předpokládaných případů TB v Indii diagnostikovaných pomocí mikroskopie sputum a pouze 21% testovaných pomocí molekulárního testu Jak nedávno v roce 2023, Indie se nadále spoléhá na mikroskopii pro diagnostiku TB. Navzdory nárůstu zařízení pro molekulární testování z 5 090 v roce 2022 na 6 496 v roce 2023 není nikde blízko k splnění národního strategického plánu 2017–2025 snížení spoléhání se na rozmazání mikroskopie.
Publikováno – 12. dubna 2025 23:00 je
