Všechny tři kočky, které byly testovány pozitivně na h5N1 Clade 2.3.2.1a, zemřely jeden tři dny po vzorkování | Foto kredit: Reuters
Dvouletá dívka z Narasaraopeta v okrese Palnadu, Andhra Pradesh, která byla infikována H5N1, zemřela 16. března 2025; 4. března byla přijata na AIIMS-MANGALAGIRI. Výzkum a diagnostická laboratoř ICMR (VRDL) identifikoval virus jako chřipku A 7. března. Na směru ICMR byly vzorky zaslány do Národního institutu virologie (NIV) v podéle virus virus. NIV identifikoval virus jako N5N1 a ICMR upozornil státní vládu 31. března tohoto roku.
Dokonce i tři týdny po NIV virus jako H5N1 neexistují žádné informace o tom, do kterého clade virus H5N1 patří. Stanovení kladu fylogenetickou analýzou je jednoduchý a automatizovaný postup, a proto lze provést okamžitě po sekvenování genomu.
Neochota výzkumných pracovníků NIV sdílet životně důležité informace nebo rychle ukládat údaje o sekvenci genomu ve veřejných databázích není nic nového. Ať už je to virus Zika, Nipah nebo Monkeypox, data genomu z NIV jsou k dispozici pouze tehdy, když je dokument o viru publikován ve vědeckém časopise o rok nebo dva později; NIV zveřejnil dva předtisky výsledků studie Monkeypox. Dokonce i během pandemie byly údaje o sekvenci genomu prvních dvou případů SARS-CoV-2 zjištěných v Kerale zveřejněny NIV ve veřejné databázi-Gisaid-den poté, co byla označena položkou označující problém 4. března 2020 v Hindu.
Vědci NIV upřednostňují publikaci papíru před volným a okamžitým přístupem k údajům o sekvenci genomu a dalším životně důležitým informacím byla znovu pozorována v případě jedenáctiletého dítěte infikovaného H5N1 v roce 2021. 15. července 2021 bylo vědci NIV v H5N1 infikováno H5N1. Dítě zemřelo 12. července 2021. Přestože není známo, kdy byl genom sekvenován a byla provedena fylogenetická analýza, vědci NIV předložili genomovou sekvenci v GenBank v říjnu 2021. Ale sekvenční údaje byly veřejně přístupné až po osmi měsících 2. června 2022, kdy vědci NIV zveřejnili výsledky v časopise. Že dítě bylo infikováno h5N1 clade 2.3.2.1a, bylo známo pouze tehdy, když byl papír publikován.
Naproti tomu 2,5letá dívka, která se vrátila do Melbourne po návštěvě Kalkaty mezi 12. únorem a 29. únorem 2024 a hospitalizována 2. března 2024 dní po jejím návratu z Indie byl nakažen Clade H5N1 2.3.2.1A. Státní viktoriánské ministerstvo zdravotnictví tento případ potvrdilo 18. května 2024. O čtyři dny později 22. května byly úplné informace o případu, včetně detailů kladu, sdíleny s WHO měsíců před zveřejněním výsledků v lednu 2025. A co je nejdůležitější, údaje o sekvenci genomu byly zveřejněny na GISAID, což je veřejná databáze, 22. května 2024, téhož dne byl informován.
Zaměřte se na Clade 2.3.2.1a
Existuje důvod, proč je velmi důležité vědět, zda virus H5N1 nalezený v dítěti v okrese Palnadu, Andhra Pradesh patří Clade 2.3.2.1a. Clade 2.3.2.1a najednou získala více pozornosti. Národní institut onemocnění zvířat s vysokou bezpečnosti v Bhopalu identifikoval reassortant H5N1 Clade 2.3.2.1A virus ve třech domácích vzorcích koček shromážděných 16. ledna a 24. ledna letošního roku z města Chhindwara v Madhya Pradesh. Na rozdíl od NIV vědci Nihsad rychle sdíleli podrobnosti o kladu a přestavbě viru v předtisku zveřejněném 23. února 2025.
Fylogenetická analýza ukázala, že virus N5N1 ze tří vzorků CAT jsou reassortantní viry. Podle předtisku „čtyři genové segmenty úzce souvisely s viry H5N1 Clade 2.3.2.1A cirkulující v Bangladéši, zatímco zbývající čtyři segmenty seskupily viry Clade 2.3.4.4B“. Zatímco segment matrice seskupil s virem H5N1 Clade 2.3.4.4B detekovaný u divokého ptáka v Jižní Koreji, komplex genu polymerázy seskupil s viry H5N1 2.3.4.4B detekované u drůbeže a divokých ptáků v Asii.
„Ačkoli viry koček postrádaly klasické adaptační markery savců, nesli mutace spojené se zvýšenou polymerázovou aktivitou v savčích buňkách a zvýšenou afinitu k receptorům kyseliny 2-6 sialové, což naznačuje jejich potenciální roli při usnadňování infekce u koček,“ píšou. „Identifikace virů reassortant H5N1 Clade 2.3.2.1A u domácích koček v Indii zdůrazňuje naléhavou potřebu zvýšeného dohledu u domácí drůbeže, divokých ptáků a savců, včetně lidí, ke sledování genomické rozmanitosti a molekulární evoluce cirkulačních kmenů.“ “
Podle Světové organizace pro zdraví zvířat, od 20. února 2025, byl H5N1 nalezen u 99 koček a zabil 18 koček. „Vzhledem k tomu, že H5N1 byl nalezen u domácích koček, existuje zvýšené riziko šíření viru na člověka kvůli zvýšeným šancím na expozici,“ říká výzkumník Hindu. „Jakýkoli přelévání savců, které jsou v tomto případě kočky, a pokračující infekce, má možnost přizpůsobit se přenosu savců (jako v případě skotu v USA) a nakonec lidem vystavením.“
Publikováno – 19. dubna 2025 23:00 je
