DBT dokončila výzvu k návrhu, aniž by zveřejnila, jaké údaje o fenotypu jsou k dispozici. | Foto kredit: iStockphoto
9. ledna 2025 ministerstvo biotechnologie (DBT) požadovalo návrhy na „translační výzkum využívající data genomeindia“ od vědců se sídlem v Indii. 20. února, osm dní před termínem 28. února pro předložení návrhů, DBT prodloužila lhůtu do 31. března 2025.
10 000 projekt lidského genomu shromáždil vzorky krve a související údaje o fenotypech od více než 20 000 jedinců představujících 83 populačních skupin-30 kmenových a 53 ne-tribalských populací-rozšířených po celé Indii. Z 20 000 jedinců byly v časopise Nature Genetics jako komentář 8. dubna zveřejněny předběžná zjištění založená na genetických informacích 9 772 jedinců.
Článek komentáře jasně uvedl fenotypová data shromážděná od více než 20 000 lidí, včetně výšky, hmotnosti, obvodu kyčle, obvodu pasu a krevního tlaku. Ze odebraných vzorků krve byly změřeny úplné počty krve a údaje o biochemii, jako jsou měření glukózy, profily lipidů a testy funkcí jater a ledvin a jsou k dispozici spolu s údaji o genomech 9 772 jedinců. Překvapivě ani první výzva k návrhu, ani dodatky, které prodlužují termín pro předložení návrhů uvedených na uvedení, jaké údaje o fenotypu byly vědcům k dispozici. Ani web Genomeindia tyto informace nemá. Poprvé, kdy se tato informace stala veřejností, bylo, když byl článek komentáře zveřejněn 8. dubna. Uzávěrka pro předložení návrhů byl 31. března.
„Údaje o antropometrické a krevní biochemii byly shromážděny pouze, aby se zajistilo, že vzorky pokryté v projektu genomeindia byly od zdravých jedinců,“ říká mluvčí DBT v e -mailu pro hinduisty.
„Projekt genomeindia nevydal datový slovník ani nezveřejnil podrobné informace o dostupných metadatech fenotypů genotypovaných vzorků v projektu. Komentář v přírodě Genetics Journal byl první a jedinou veřejnou komunikací o detailech fenotypových metadata v projektu, dosud se uvádí, že ultónová data,“ říká Dr. Padmanab, „uvádí, že Dr. PadmanabInsko,“ říká, že uldifikuje údaje, “říká, že uzl.“ V, docent profesor na Katedře biochemie v CMC Vellore.
Mimochodem, dodatky zveřejněné 20. února prodloužení termínu do 31. března poznamenalo, že DBT „obdržela mnoho dotazů týkajících se typu údajů, které budou zveřejněny“. Navzdory tomu, že „relevantní údaje o fenotypu (podle žádosti)“ budou poskytnuty v rámci kontrolovaného (spravovaného) přístupu, jaké údaje o fenotypu nebyly k dispozici. „Přestože připustili, že na seznamu dostupných fenotypů, které mohou vědci požádat i v tomto dokumentu, došlo k mnoha dotazům souvisejícím s údaji, stále nebyly žádné informace o seznamu dostupných fenotypů,“ říká Dr. Padmanaban.
Rovněž byl zmíněn kus komentářů zveřejněného v časopise, který je jediným místem, kde jsou údaje o fenotypu shromažďovány a dostupné, stojí za výplatou, čímž některé vědci omezují, aby jej přečetli. Mluvčí poukazuje na to, že systém předplatného One Nation One poskytne přístup k výzkumným článkům a deníkovým publikacím studentům, fakultám a vědcům. Schéma předplatného One Nation One však v současné době poskytuje volný přístup k časopisovým článkům pro vědce a studenty pouze z veřejných institucí.
Zatímco vědci z 20 institucí zapojených do projektu Genomeindia by si byli vědomi dostupných údajů o fenotypech, ostatní by o tom nevěděli. „Vědci, kteří nebyli součástí projektového týmu Genomeindia, neměli informace o dostupných metadatech fenotypu,“ říká Dr. Padmanaban. „Nejen data genomeindia, ale na jakékoli biologické údaje dostupné v IBDC mohou být přístupné vědci podle ustanovení v pokynech pro biotechnologii Pride a protokoly krmení, které jsou v souladu s praktikami následovanými mezinárodními databázemi,“ říká mluvčí.
Publikováno – 27. dubna 2025 05:00
