Analýza genu ve velkém měřítku identifikuje nové biomarkery a cíle léčiva pro plicní adenokarcinom

Analýzou desítek tisíc genů, proteinů a proteinových modifikací ve stovkách plicních nádorů odhalil mezinárodní výzkumný tým nové faktory spojené se špatnými výsledky u plicního adenokarcinomu u kuřáků i lidí, kteří nikdy nekouřili. Mezi tyto faktory patří vzorec poškození DNA a podpisy expozic chemikáliím nalezené ve zpracovaných potravinách a kosmetice. Zjištění by mohla vést k lepší precizním strategiím medicíny pro tento nejčastější typ rakoviny plic.

Vědci systematicky studovali geny a proteiny v celém genomu a proteomu v plicní nádory a spárované nekancerózní plicní tkáně od více než 400 pacientů ze Severní Ameriky, východní Evropy a Asie, což z něj činí největší „proteogenomickou“ studii jakékoli rakoviny dosud.

Vytvořením a studiem tohoto podrobného molekulárního portrétu Adenokarcinom plicTým našel:

• Několik kandidátních biomarkerů, které by mohly být použity k přesněji identifikaci pacientů se špatnými prognózami
• Silná souvislost mezi špatnými výsledky a typem poškození DNA v nádorech, ve kterých byla DNA rozdělena na mnoho malých fragmentů
• Biologické mechanismy, které jsou základem podmnožiny nádorů v rané fázi, které se chovají spíše jako pokročilé rakoviny
• Více než dvě desítky molekul nádorů, které by mohly být potenciálně zacíleny stávajícími léky schválenými FDA, sloučeniny Klinické studienebo nové léky, které ještě musí být vyvinuty.

Práce, publikovaná v Rakovinná buňkaByli vedeni vědci z Broad Institute, Academia Sinica na Tchaj -wanu, University of Michigan v Ann Arbor a dalšími institucemi, a je výsledkem bezprecedentní spolupráce mezi konsorciem pro proteomické proteomické proteomické nádory (CPTAC) (CPTAC), která vychází z více než jen tukových konsorcií.

Kvůli této spolupráci byl tým přístup k velkému počtu vzorků nádoru a hluboce analyzovat řadu Rakovina plic Rizikové faktory, které dosud nebyly dobře studovány, jako jsou expozice chemikáliím mimo tabákový kouř.

„Rakovina plic je i nadále předním zabijákem rakoviny po celém světě, a přestože jsme dosáhli pokroku, není to vyřešený problém,“ řekl Michael Gillette, autor spolu-seniorské studie a vedoucím skupiny a hlavním vyšetřovatelem na proteomické platformě na Broad.

„Doufám, že je to, že přinesením nového porozumění biologii plicního adenokarcinomu, navrhováním některých terapeutických strategií a nových způsobů, jak identifikovat vysoce rizikové pacienty, a také poskytnutím důležitého zdroje pro vědce, naše práce položí základy pro lepší způsoby diagnostiky a léčby tohoto smrtícího rakoviny.“

„Rozsáhlá spolupráce, jako je tato, umožňují přístup k geneticky a geograficky rozmanitým vzorkovým souborům, díky čemuž je tato studie více odrážející rozmanitost plicního adenokarcinomu,“ uvedl Shankha Satpathy, spolupravík autor studie a vedoucí vedoucí skupiny a hlavní vyšetřovatel a hlavní vyšetřovatel a hlavní vyšetřovatel a hlavní vyšetřovatel a hlavní vyšetřovatel a hlavní vyšetřovatel a hlavní vyšetřovatel a hlavní vyšetřovatel a hlavní vyšetřovatel a hlavní vyšetřovatel a hlavní vyšetřovatel a hlavní vyšetřovatel a hlavní vyšetřovatel a hlavní vyšetřovatel a hlavní vyšetřovatel skupiny.

Atlas rakoviny plic

Navzdory novým cíleným terapiím pro rakovinu plic za poslední dvě desetiletí plicní adenokarcinom stále zabíjí většinu pacientů, včetně mnoha, kteří nikdy nekouřili, což naznačuje potřebu hlubšího pohledu na nemoc.

Ve své studii vědci zjistili, že pacienti, kteří měli nádory s DNA, která byla rozložena na mnoho malých kusů, měli horší prognózy. Vědci určili potenciální biomarker, protein zvaný IGF2BP3, jehož hladiny korelovaly s intenzitou této genomové fragmentace. Tým uvedl, že tento kandidátský biomarker by mohl být potenciálně použit k identifikaci pacientů se zvýšeným rizikem závažného onemocnění.

Vzhledem k velké velikosti vzorku studie se vědci mohli ponořit do účinků karcinogenů, jako je tabákový kouř, znečišťující látky a chemikálie zvané nitrosaminy, které se nacházejí ve zpracované potravě a kosmetice. Vědci hledali molekulární podpisy spojené s expozicemi kouření a nitrosaminu a zjistili, že pacienti, kteří měli nejsilnější nitrosaminové podpisy, byli většinou nikdy kuřáci, kteří se přesto dařili stejně špatně jako ti, kteří kouřili.

Toto překvapivé zjištění naznačuje, že nitrosaminy mohou být důležitým přispěvatelem k riziku rakoviny plic u lidí, kteří nikdy nekouřili. Tým vytvořil panel kandidátů na biomarkery, který by mohl potenciálně poskytnout prognostické signály pro nemoc u lidí s vysokými chemickými expozicemi.

Vědci se také dozvěděli více o nedávno objevené podskupině plicního adenokarcinomu, kde pacienti mají nádory, které vypadají jako onemocnění v rané fázi podle konvenčních opatření, ale mají molekulární charakteristiky a výsledky rakoviny v pozdním stádiu. Vědci odhalili nové podrobnosti o základní biologii, která podporovala tuto „počáteční, pozdní“ formu a navrhli, aby tito pacienti mohli mít prospěch z užšího monitorování a intenzivnější léčby.

Gillette uvedla, že studie ukazuje sílu mezinárodní spolupráce a rozsáhlé genomické a proteomické analýzy rakoviny, která může připravit cestu k lepší klinické péči.

„Způsob, jakým nyní děláme prognózu, je založen na klinických opatřeních a na tom, jak se biopsie nádorů vypadají pod mikroskopem,“ řekla Gillette. „Ale pokud se můžeme pohybovat směrem k používání molekulárních podpisů z nádorů k určení prognózy rakoviny, mohli bychom udělat lepší práci a hledat ty rakoviny v raném stádiu, které se stanou agresivními a léčbu těchto pacientů dříve a efektivněji, aby zachránily více životů.“