Jak genomické screening u novorozenců zjistilo 16 skrytých poruch standardních testů

Odkrýváním genetických stavů měnících život před příznaky by mohlo genomické screening předefinovat péči o novorozence, pokud zdravotní systémy mohou technologii zodpovědně škálovat.

Studie: Proveditelnost, přijatelnost a klinické výsledky studie pro chůva+ genomické novorozence. Obrázek kredit: Sergei Drozd / Shutterstock

V nedávném článku v časopise Přírodní medicínaVědci prozkoumali proveditelnost začlenění WGS do NBS pro 1 000 australských kojenců. Zatímco standardní screening identifikoval hypotyreózu biochemicky u jednoho kojence, začlenění WGS objasnilo v tomto případě genetickou příčinu a zvýšilo tento počet na 16 zjištění s vysokou šancí, což umožňuje rodičům a poskytovatelům zdravotní péče odpovídajícím způsobem upravit péči. Rodiče také považovali postup přijatelný a nezdá se, že by litovali, že budou souhlasit s screeningem.

Pozadí

NBS je již dlouho účinným zásahem veřejného zdraví a umožňuje včasnou detekci a léčbu vzácných, vážných podmínek. Tradiční NBS se však spoléhá na biochemické markery, které omezují rozsah detekovatelných poruch a často zaostávají za pokroky v přesnosti medicíny.

Rostoucí schopnosti genomického sekvenování nabízejí potenciál k výraznému rozšíření NBS identifikací stovek genetických stavů, včetně těch bez biochemických ukazatelů, a umožňují opětovné použití celoživotních dat diagnóza a výzkum.

Navzdory svému slibu, genomického screeningu novorozenců (Nams) vyvolává několik problémů s implementací, jako je určení, které podmínky zahrnout, jak a kdy získat souhlas, metoda optimálního testování a jak řídit důsledky systému zdravotní péče. Mezinárodně jen málo prospektivních studií poskytlo důkazy v reálném světě na vedení politiky.

Nedávno spuštěné programy jako Guardian (USA) a BabyDetect (Belgie) zkoumají proveditelnost v měřítku. Ve Victoria v Austrálii byla studie hlídacího obrazu+ navržena tak, aby se zabývala klíčovými mezerami znalostí testováním praktičnosti, klinické hodnoty a psychosociálního dopadu nabízení novorozeneckých screeningů založených na WGS na 605 genů spojených s časným nástupem, léčitelné genetické podmínky v oblasti veřejné zdravotní péče, spolu s biochemickou NB.

O studii

Studie Babyscreen+ byla prospektivním kohortním projektem prováděným ve Victoria v Austrálii, aby se testovala proveditelnost a přijatelnost rodičů GNBS pomocí WGS. Vědci zapsali 1 000 novorozenců, jejichž rodiče poskytli informovaný souhlas pro standardní i genomický screening. K náboru došlo během pozdního těhotenství nebo do dvou týdnů po narození ve veřejných a soukromých nemocnicích. Informace byly poskytovány prostřednictvím zdravotnických pracovníků, sociálních médií a nástroje pro podporu digitálního rozhodování.

Genetický materiál byl extrahován ze sušených krevních skvrn (DBS) po standardní NBS (stdnbs) a sekvenování do průměrné hloubky pokrytí 30 ×. Data byla analyzována zaměřením na 605 genů spojených s léčitelnými poruchami s časným nástupem. Byly hlášeny pouze patogenní nebo pravděpodobné patogenní varianty konzistentní se vzory dědičnosti; Byly vyloučeny nosič nebo nejisté varianty. Výsledky byly kategorizovány jako vysoká šance nebo nízká šance, pomocí přísných kritérií, aby se zabránilo falešným pozitivům, s genetickým poradenstvím zajištěným bývalým.

Je důležité, že v případě potřeby bylo provedeno přepracování vzorků DBS, což je krok, který zabránil dvěma zmeškaným diagnózám, včetně život ohrožující imunitní poruchy UNC13D. Rodiče také dokončili průzkumy a volitelné rozhovory, aby posoudili postoje, úzkost a rozhodovací lítost. Kvantitativní údaje byly analyzovány pomocí standardních statistických metod, zatímco kvalitativní rozhovory byly kódovány a tematicky analyzovány.

Klíčová zjištění

Z 1 288 rodičů, kteří vyjádřili zájem, bylo do studie zapsáno 1 000 novorozenců, s mírně vyšší účastí mezi staršími, městskými a vzdělanými rodiči. Nábor prostřednictvím zdravotnických pracovníků přinesl nejlepší míru dokončení, zatímco sociální média se ukázala jako užitečná doplňková metoda.

Sekvenování z karet DBS se ukázalo jako proveditelné: ačkoli 3,2% vzorků vyžadovalo přepracování v důsledku problémů souvisejících s vzorkem, procedurální vylepšení zvýšila včasné hlášení na 81% snížením selhání sekvenování. Autoři zdůraznili, že rozhodnutí, že se nerereproces nevyskytne, by mělo za následek zmeškané nálezy, které lze provést, což by podtrhlo potřebu přísného zpracování vzorků v GNBS.

Z 1 000 testovaných novorozenců mělo 16 (1,6%) vysokoškolské genetické výsledky, vše potvrzeno pomocí následného testování. Tato zjištění vedla k různým klinickým účinkům, od preventivní péče a monitorování až po okamžité léčebné intervence, jako je řízení metabolického rizika během chirurgického zákroku nebo transplantace časné kostní dřeně u imunitních poruch.

Důležité je, že standardní NBS detekoval pouze jeden z těchto 16 případů, což zdůraznilo přidanou hodnotu genomického screeningu. Testování členů rodiny identifikovalo 20 dalších diagnóz prostřednictvím kaskádového testování a rozšiřovalo klinické přínosy nad novorozence.

Rodičovská zpětná vazba naznačila vysokou spokojenost: Většina rodičů zjistila, že rozhodování je snadné, vykázala nízkou úzkost a lítost, se středním rozhodnutím o lítosti 0 a silně podporovala rozšíření GNB. Více než 99% se domnívalo, že by mělo být k dispozici všem rodinám, a 97% podporovalo veřejné financování, což prokázalo široké přijetí a proveditelnost integrace genomického screeningu do rutinní péče o novorozence.

Závěry

Studie Babyscreen+ prokázala, že GNBS může účinně identifikovat širší rozsah závažných, léčitelných dětských podmínek než STDNBS, což detekuje 1,6% kojenců s akčními genetickými varianty. Program se ukázal jako proveditelný a přijatelný a integroval genomické sekvenování do stávajících systémů zdravotní péče s rychlým obratem a minimálním narušením. Rodiče ohromně podporovali GNBS a vykazovali nízkou úzkost a rozhodovací lítost.

Mezi silné stránky studie patří jeho klinicky akreditované sekvenování, použití DB, účinné automatizace a multidisciplinární hodnocení, to vše přispívá k spolehlivým a včasným výsledkům. Autoři však poznamenali, že více než polovina případů stále vyžaduje manuální přezkum odborníka, což znamená, že současný pracovní postup není dosud plně škálovatelný a bude vyžadovat další automatizaci bez ohrožení přesnosti.

Omezení zahrnovala malou velikost kohorty, krátké trvání studie a nadměrné zastoupení vysoce vzdělaných účastníků, což může omezit zobecnění. Šroubování programu na celostátní úrovni by vyžadovalo významné investice do infrastruktury a pracovních sil spolu s hodnocením vlastního kapitálu a přístupu napříč různými populacemi.

Celkově poskytuje hlídač+ silné důkazy o tom, že GNB jsou proveditelné, přijatelné a klinicky cenné, ale pro vyhodnocení spravedlnosti, nákladové efektivity a udržitelnosti jsou zapotřebí další rozsáhlé a dlouhodobé studie.