MOd začátku pandemie Covid-19, ruda než čtyři roky, zůstává nemoc globálním zdravotním problémem-ne kvůli novým nárůstům, ale kvůli tomu, co přetrvává. Dlouhé Covid nebo technicky post-akutní následky infekce SARS-CoV-2 (PASC) se vztahují na příznaky, které pokračují týdny nebo měsíce poté, co se počáteční nemoc vyjasní. Patří sem únava, dýchací problémy a kognitivní problémy. Světová zdravotnická organizace definuje dlouhé Covid jako příznaky, které začínají do tří měsíců po infekci a trvají nejméně dva měsíce bez dalšího vysvětlení.
Proč se někteří lidé vyvíjejí dlouhé Covid, zatímco jiní se rychle zotaví, zůstává nejasný. Nedávná studie asociace v celém genomu zveřejněná v Přírodní genetika Analyzovala genetická data ze šesti hlavních globálních předků, aby prozkoumala, zda zděděné rozdíly hrají roli.
Rozmanitá studie
Studie provedená v rámci iniciativy hostitelské genetické iniciativy COVID-19 na výzkumném institutu Grias I Pujol ve Španělsku ve Španělsku použila k identifikaci genetických rizikových faktorů pro dlouhou Covid asociační studii celé genomu (GWAS). GWAS skenuje genom pro malé „pravopisné chyby“-známé také jako jednonukleotidové polymorfismy-v sekvenci DNA, které se objevují častěji u lidí s podmínkou než u těch bez. Tato metoda pomohla odhalit vazby na mnoho složitých a chronických poruch.
Analýza použila data z 33 skupin ve 19 zemích, což z něj činí jedno z největších úsilí dosud v této oblasti. Vědci nejprve analyzovali údaje z 6 450 dlouhých případů Covid a více než milion populačních kontrol. V této fázi objevování identifikovali genetický signál poblíž genu FOXP4. Tento signál byl poté testován v samostatné replikační kohortě více než 9 500 případů a téměř 8,00 000 kontrol a byla potvrzena asociace.
Vědci použili dvě definice dlouhého Covida: přísnou, což vyžaduje testovací potvrzenou infekci a probíhající příznaky, a širší, která zahrnovala samostatně hlášené nebo klinické diagnózy. Kontroly byly také definovány striktně (infikované, ale zotavené) nebo široce (obecná populace bez dlouhého covidu). To pomohlo týmu otestovat, zda jeho výsledky se držely v různých klinických definicích.
Gen spojený s dlouhým rizikem covidu
Analýza zjistila silnou souvislost mezi dlouhým Covidem a oblastí na chromozomu 6, poblíž genu FoxP4. Specifická varianta v regionu, zvaná RS9367106, zvýšila riziko vzniku dlouhého Covidu. Lidé s verzí „C“ této varianty byli asi o 63% vyšší pravděpodobnost, že budou mít dlouhé příznaky covidu než ty bez ní.
Zejména FOXP4 zvýšil dlouhé riziko covidu i u lidí, kteří nebyli hospitalizováni, což naznačuje, že jeho účinek není vázán pouze na závažnost počáteční infekce. Frekvence varianty se také lišila napříč populacemi. Objevilo se to asi 1,6% nefunkčních Evropanů, ale až 36% východních Asiatů. Protože to bylo běžnější v některých skupinách, jeho účinky bylo snazší detekovat, dokonce i v menších vzorcích.
To zdůrazňuje, proč jsou genetické studie, které zahrnují rozmanité populace, spolehlivější a globálně relevantní.
Od plic po imunitu
Abychom porozuměli spojení mezi FOXP4 a dlouhým Covidem, vědci zkoumali, jak byl tento gen aktivní v různých tkáních a typech buněk a jak jeho aktivita souvisela s podmínkou.
Autoři poznamenali, že varianta spočívá v úseku DNA, která je obzvláště „aktivní“ v plicní tkáni, což naznačuje, že může ovlivnit to, jak plíce fungují. Pomocí databáze velké genové aktivity s použitím GTEX zjistili, že blízká varianta (RS12660421), často zděděná s RS9367106, byla spojena s vyššími hladinami exprese FOXP4 v plicích. To zvětšilo pravděpodobnost, že gen ovlivňuje to, jak plíce reagují na infekci a poranění.
Dále vědci zkontrolovali, které plicní buňky produkovaly FOXP4 nejsilněji. Zjistili vysokou aktivitu v alveolárních buňkách typu 2, klíčových hráčů při udržování otevřených vzduchových vaky, čištění tekutin a opravy poškození tkáně. Tyto buňky také pomáhají koordinovat imunitní odpověď na respirační viry, jako je SARS-CoV-2. Stejná genetická oblast byla také spojena s rakovinou plic v dřívějším výzkumu, což naznačuje, že FOXP4 může ovlivnit několik podmínek souvisejících s plicemi prostřednictvím sdílených biologických drah.
Pro testování, zda aktivita FOXP4 – a nejen s genetickou variantou – může být spojena s dlouhým Covidem, vědci analyzovali vzorky krve od lidí, kteří se zotavili z počáteční fáze infekce. Zjistili, že jedinci s mírně vyššími hladinami FOXP4 měli více než dvojnásobek šance na rozvoj dlouhého Covidu. Tato asociace přetrvávala i mimo fázi akutního onemocnění, což naznačuje dlouhodobou roli genu.
Nakonec technika zvaná ko-lokalizační analýza ukázala 91% pravděpodobnost, že stejný genetický signál ovlivňuje jak aktivitu FOXP4, tak dlouhé riziko covidu, což posiluje biologický význam genu.
Indické genomické mezery
Studie má důležité důsledky pro Indii, vzhledem k její velké populaci, genetické rozmanitosti a významné zátěži Covid-19. Více vln infekce a nerovný přístup k péči znamená, že mnoho Indiánů může i nadále čelit trvalým příznakům, často nediagnostikovaným nebo neléčeným kvůli omezenému povědomí a klinickému sledování.
Indické studie naznačují široký rozsah dlouhé prevalence Covid: od 45% na téměř 80% v závislosti na návrhu, sledování a závažnosti nemoci. Jedna multicentrická studie napříč Hyderabad, Vellore, Bombaj a Thiruvalla zjistila, že 16,5% hospitalizovaných pacientů samostatně hlášených symptomů, jako je únava a bez dechu, dokonce rok po propuštění.
Ačkoli GWAS zahrnoval účastníky ze šesti skupin předků, autoři uvedli, že většina datových sad byla evropského původu. Jihoasijská reprezentace byla omezená nebo nejasná. Jedná se o širší problém napříč GWA obecně, z nichž mnohé se zaměřily na evropské populace. Zůstává tedy nejisté, jak často se varianta FOXP4 vyskytuje v indické populaci nebo zda jsou její účinky podobné v místních kontextech, zejména vzhledem k faktorům specifickým pro region, jako je znečištění ovzduší, metabolické riziko a variabilita zdravotní péče.
Rostoucí genomická infrastruktura Indie začíná uzavírat mezery v oblasti základních dat. Projekt Genomeindia vydal genomická data o 10 000 jednotlivcích z různých indických populací. Přestože se projekt nezaměřuje na mapování nemocí, poskytuje základní katalog genetické variace napříč populacemi. Tento odkaz může podporovat budoucí studie, jako je indicko-specifický GWAS na Long Covid, a tak budovat důvěru v převádění zjištění do klinického nebo diagnostického prostředí v místních kontextech.
Některá omezení
Tato rozsáhlá mezinárodní studie identifikuje FOXP4 jako genetický faktor spojený s dlouhým Covidem a nabízí nové vodítko, proč někteří jednotlivci zažívají prodloužené příznaky po infekci SARS-CoV-2.
Autoři však také všimnou několika omezení.
Většina údajů byla shromážděna před rozsáhlým očkováním a vznikem novějších variant, jako je Omicron, takže je nejasné, zda se zjištění vztahují na všechny populace dnes. Upozorují také, že vyvíjející se definice dlouhého Covidu mohly v některých kohortách vést k nesprávné klasifikaci.
Celkový genetický příspěvek k dlouhému Covidu se navíc jeví jako skromný, což naznačuje, že klíčové role také hrají i další faktory, včetně imunity a již existujících podmínek.
Vzhledem k tomu, že Indie pokračuje v řešení dlouhodobých účinků pandemie, studie, jako je tato, zdůrazňují důležitost zahrnutí rozmanitých populací do genetického výzkumu.
Takové úsilí může zlepšit reakce veřejného zdraví a pomoci přizpůsobit péči pro ty, kteří žijí s dlouhým Covidem.
Anirban Mukhopadhyay je genetickým tréninkem a vědeckým komunikátorem z Dillí.
Publikováno – 16. června 2025 08:30
