Severozápadní vědci vytvářejí nové skóre genetického rizika, aby zlepšili předpověď arytmie

V nové studii Northwestern Medicine vědci vyvinuli přesnější skóre genetického rizika, aby určili, zda se u člověka pravděpodobně vyvine arytmie, nepravidelný srdeční tep, který může vést k vážným stavům, jako je fibrilace síní (AFib) nebo náhlá srdeční smrt.

Jejich přístup nejen zlepšuje přesnost předpovědi rizika srdečních onemocnění, ale také nabízí komplexní rámec pro genetické testování, které by podle vědců mohlo být aplikováno na cokoli, včetně dalších složitých, geneticky ovlivněných onemocnění, jako je rakovina, Parkinsonova choroba a autismus.

Je to velmi cool přístup, ve kterém kombinujeme vzácné genové varianty s běžnými genovými variantami a pak přidáváme nekódující genomové informace. Pokud je nám známo, nikdo předtím tento komplexní přístup nepoužil, takže je to skutečně plán, jak toho dosáhnout.“

Dr. Elizabeth McNally, spolukorespondentka, ředitelka Centra pro genetické testování a profesorka medicíny, divize kardiologie a biochemie a molekulární genetiky, Northwestern University Feinberg School of Medicine

Zjištění také položilo základy pro vývoj cílených terapií přizpůsobených úplnému genetickému profilu člověka, uvedli autoři. A lékaři budou schopni odhalit riziko člověka ještě předtím, než se objeví příznaky.

Studie zahrnující 1119 účastníků bude zveřejněna 11. listopadu Cell Reports Medicine.

Kombinace všech tří typů genetického testování

V současné době je genetické testování rozděleno do tří odlišných přístupů:

• Monogenní testování: Detekuje vzácné mutace v jediném genu, podobně jako rozpoznání překlepu v jednom slově
• Polygenní testování: Posuzuje několik společných genových variant, aby porozuměl celkovému riziku, jako je analýza tónu kapitoly knihy
• Sekvenování genomu: Přečte celý genetický kód, podobně jako čtení přebalu knihy

„Genetičtí výzkumníci, společnosti a genetici často pracují v silech,“ řekl McNally. „Společnosti, které nabízejí testování genového panelu, nejsou tytéž, které poskytují skóre polygenního rizika.“

V této studii výzkumníci integrovali data ze všech tří genomových kompartmentů, aby vytvořili 360stupňový pohled na riziko onemocnění. Jejich přístup identifikuje vzácné mutace, vyhodnocuje kumulativní genetické vlivy a odkrývá skryté vzorce v celém genomu.

„Když sekvenujete celý genom, můžete říct: ‚Nech mě se na to podívat kardiomyopatie genová složka, genový panel a polygenní složka.“ Kombinací dat dohromady získáte velmi vysoký poměr šancí na identifikaci toho, kdo je vystaven nejvyššímu riziku, a to je místo, kde si myslíme, že tento přístup může skutečně zlepšit to, co se v současnosti používá,“ řekl McNally.

Proč by mělo více lékařů objednávat genetické testy

Kardiologové tradičně hodnotí srdeční riziko vyhodnocením příznaků, rodinné anamnézy a diagnostických testů, jako jsou EKG, echokardiogramy a MRI. McNally také začleňuje genetické testování do své praxe, řekla.

„Pomáhá mi to lépe zvládat toho pacienta, vědět, kdo je v největším riziku, a pokud si myslíme, že riziko je opravdu vysoké, doporučíme pro takové pacienty defibrilátory,“ řekl McNally. „Vědění je síla.“

Navzdory svému potenciálu zůstává genetické testování nedostatečně využíváno, řekl McNally a dodal, že se odhaduje, že pouze 1 až 5 % lidí, kteří by měli podstoupit genetické testování, je skutečně využívá. Dokonce i v onkologické péči, kde jsou genetické vazby dobře zavedené, podstoupí testování pouze 10 až 20 % pacientů.

„Musíme zlepšit příjem,“ řekl McNally. „Největší výzvou je pracovní síla, která není vyškolena v tom, jak používat genetické testování. S tím, jak se skóre polygenního rizika stává běžnějším, náš přístup bude ještě cennější.“

Jak studie probíhala:

Vědci přijali 523 účastníků, kteří měli arytmie a někteří z těchto lidí měli také srdeční selhání. Tým pečlivě prošel každý případ, prozkoumal každý záznam, aby se ujistil, že účastníci skutečně měli arytmie, včetně sledování dat přímo ze zařízení pacientů. Nakonec sekvenovali genomy pacientů pomocí monogenetického a polygenetického testování, aby určili rizikové skóre a porovnali výsledky s genomy 596 kontrolních účastníků z biobanky NUgene ve věku 40 a více let bez známé historie srdečního onemocnění.

„Bylo to pracné projít přes 500 záznamů a ujistit se, že lidé ve studii do studie skutečně patřili,“ řekl McNally.

Studie se jmenuje „Kombinované skóre náchylnosti k genomové arytmii vymezuje kumulativní riziko.“ Mezi další autory Northwestern studie patří Tanner Monroe, Megan Puckelwartz, Lorenzo Pesce, Dr. Alfred George a Dr. Gregory Webster.