Studie odhaluje, jak protein PAX3 řídí růst melanomu

PAX3 je transkripční faktor (proteiny zapojené do přeměny DNA na RNA), který řídí progresi melanomu podporou růstu buněk, migrace a přežití, zatímco inhibuje diferenciaci buněčné terminálu, což je konečná fáze, kde se buňka stává specializovaným a končí dělení buněk. Známé cílové geny PAX3 jsou však omezené a nemohou plně vysvětlit široký dopad funkce PAX3, což naznačuje, že s největší pravděpodobností existuje mnoho dalších genů, které jsou ovládány PAX3, které jsou neobjeveny.

Protein PAX3 může regulovat DNA prostřednictvím dvou samostatných vazebných domén, párové domény (PD) a homeodomény (HD), které se vážou odlišně Motivy DNAKrátké opakující se sekvence v řetězci DNA, které regulují expresi genu. Není jasné, zda se tyto dvě domény vážou a spolupracují na regulaci genů a zda podporují všechny nebo pouze podskupinu po proudových buněčných událostech.

Nová studie vědců z Bostonské univerzity Chobanian & Avedisian School of Medicine zjistila, že PAX3 používá PD hlavně k vázání na DNA a že většinou zapíná geny, které pomáhají buňkám růst a vytvářet další proteiny-aktivity, které podporují růst rakoviny.

PAX3 je obvykle důležitý pro vývoj a růst pigmentových buněk zvaných melanocyty, ale v Melanom Je příliš aktivní a pomáhá růst rakoviny. Na naší studii je nového, že jsme použili široký a podrobný přístup, abychom přesně viděli, kde PAX3 sedí na DNA v melanomových buňkách – něco, co se tímto způsobem neuskutečnilo. “

Deborah Lang, PhD, odpovídající autorka, docentka dermatologie

Ve snaze vidět, kde se PAX3 připojuje k DNA v melanomových buňkách, vytvořili vědci počítačový program, který předpovídá, jak se PAX3 dotkne DNA – konkrétně, která část proteinu PAX3 se týká. Rovněž zkontrolovali, zda byly geny, kterých dotkne PAX3, zapnuté (aktivní) nebo vypnuté (potlačené).

Vědci se domnívají, že PAX3 by mohl být dobrým cílem pro léčbu melanomu, ale v současné době neexistují žádné léky, které by blokovaly funkci tohoto proteinu. „Protože jsme zjistili, že PAX3 pracuje převážně prostřednictvím své párové domény, navrhování léků, které blokují tuto část proteinu, by mohlo být účinným způsobem léčby melanomu,“ dodává Lang.

Tato zjištění se objevují online v časopise Geny.

Tento výzkum byl financován nadací Leo, LF-OC-21-00088; American Cancer Society, DBG-23-1152683-01-RMC, TLC-24-1345883-01-TLC a IRG-22-153-42-IRG-07; Národní ústavy zdravotnického/Národního institutu pro rakovinu, 1R03CA288281-01A1, Národní ústavy zdravotnického/Národního centra pro pokrok v oblasti translačního věd a Boston University Clinical and Translational Science Institute 1TL1TR001410 a 1UL1TR001430 a Boston University Science Institute.