Test na jazyk s výtěrem založený na CRISPR ukazuje slib pro detekci tuberkulózy

Vědci z Tulane University vyvinuli zvýšený test tuberkulózy založený na CRISPR, který pracuje s jednoduchým výtěrem jazyka, což je potenciální průlom, který by mohl umožnit snadnější komunitní promítání pro nejsmrtelnější infekční onemocnění na světě.

Současné testy TB se spoléhají na sputum, hlezek shromážděný z plic a dolní respirační systém. Přestože je pro testování bohaté na bakterie TB potřebné, je shromažďování sputa obtížné, takže je neefektivní pro rozsáhlé testování komunity. Testování sputa je také neproveditelné v přibližně 25% symptomatických případů a téměř 90% asymptomatických případů, což je mezera, která přispívá k odhadem 4 milionů případů tuberkulózy ročně nediagnostikováno.

Ve studii zveřejněné ve Přírodní komunikaceVědci z Tulane pracovali na řešení této mezery zdokonalováním dříve vyvinutého testu založeného na CRISPR, aby lépe detekovali TB ve vzorcích s velmi nízkými hladinami bakterií, jako jsou stolice, mícha a výtěry jazyka.

Klinické testování ukázalo výrazně zvýšenou detekci TB v jazykových výměnách nad tradičním testováním (74% ve srovnání s 56%).

Test také prokázal vysokou citlivost při detekci TB u respiračních (93%), pediatrické stolice (83%) a vzorků dospělých míchy (93%). U dětí, pacientů s HIV a pacienty s extrapulmonálním TBC nedokážou produkovat sputum, výzkum představuje významný krok vpřed k nabízení efektivních diagnóz prostřednictvím různých vzorků.

Více než 10 milionů lidí na celém světě onemocní tuberkulózou každý rok, ale 40% těchto případů je považováno za chybějící, protože lidé jsou nediagnostikováni. K nalezení těchto chybějících případů musí být testování méně invazivní a přístupnější k oslovení co nejvíce lidí, kteří jinak nemusí být testováni. “

Tony Hu, PhD, Odpovídající autor, Prezidentský předseda Weatherhead v biotechnologické inovaci a ředitel Centra pro molekulární a molekulární diagnostiku Tulane

Hlavní autor Zhen Huang, docent na Tulane University School of Medicine, uvedl, že vývoj životaschopného testu tuberkulózy jazyka s výtěrem může transformovat testování v komunitách s nízkým zdrojem. „Výtěry jazyka jsou bezbolestné, snadno se shromažďují a nevyžadují vyškolený zdravotnický personál,“ řekl Huang. „To otevírá dveře k rozsáhlým projekcím.“

Nová metoda CRISPR, která se nazývá ACTCRISPR-TB, zvyšuje amplifikaci a detekci genetických signálů z DNA bakterií TB a nabízí rychlý, efektivní přístup, který může vrátit diagnózu za méně než hodinu.

Pro podání testu bez potřeby laboratoře nebo vyškoleného zdravotnického personálu vyvinuli vědci přístup „One Pot“. Stejně jako test CoVID-19 je do trubice předem naloženo testovací pás a činidlo. Tato trubice je inkubována a po 45 minutách jsou barevné pásy na proužku naznačují přítomnost infekce.

I když existuje jasná potřeba rozvoje metod detekce založených na přístupu, klinické testování také ukázalo, že test je rychlejší a přesnější než tradiční testy při testování TB ve sputu nukleová kyselina.

Studie představuje nejnovější krok ve snaze HU přesunout testování TB z laboratoře a do komunity. Kromě zobrazení TB lze detekovat z jednoduchých vzorků mimo sputum, LAB HU také vyvinula rychlé testy, které poskytují výsledky za méně než hodinu na přenosných zařízeních, jedna velikost smartphonu a druhá, která nevyžaduje žádnou elektřinu. Jeho tým také použil umělou inteligenci k označení rezistence na léky, aby pacienti rychleji léčili. Společně tyto pokroky nastiňují praktickou cestu pro boj s TB: Obrazovka široce, rychle potvrďte v okamžiku péče a připojte pozitivní výsledky k efektivní léčbě.

I když je zapotřebí více výzkumu a vývoje, HU a Huang uvedli, že tato studie představuje významný pokrok.

„Pokud chceme ukončit TB, potřebujeme nástroje, které pracují mimo laboratoř a v komunitách, kde se nemoc šíří,“ řekl Hu.