Vědci uvádějí nejkomplexnější databázi proteinů lidského viru na světě

Využití síly AI, výzkumného týmu v MRC-University Glasgow Center for Virus Research spuštěno Viro3d– Nejkomplexnější databáze předpovědí proteinové struktury lidských a zvířat na světě.

Bezplatný a prohledávatelný poháněný AI databáze Nabízí zcela nový, hloubkový pohled na viry, což nám umožňuje rychle se dozvědět více o jejich původu a evoluci.

Ačkoli Virové částice jsou nejhojnější biologické entity na naší planetě, tyto malé struktury zůstávají mezi nejméně dobře pochopenými. Vhled do klíče protein Struktury uvnitř virů byly až dosud dosaženy pouze pomocí pomalých a pracných výzkumných prací, tempem, které ovlivnilo naši schopnost rozvíjet léčbu a vakcíny rychlostí.

Nyní ve snaze urychlit naše porozumění tým vědců, vedený Dr. Joe Groveem v MRC-University Glasgow Center for Virus Research, využil sílu AI k vytvoření nové databáze tisíců proteinů lidských a zvířat.

Viro3D obsahuje vysoce kvalitní strukturální modely pro 85 000 proteinů ze 4 400 virů lidských a zvířat-největší databázi kompletních strukturálních modelů pro lidské a zvířecí viry, což rozšiřuje naše současné znalosti v této oblasti 30krát.

Tvůrci Viro3D očekávají, že databáze zahájí novou éru pro výzkum viru lidských a zvířat a urychlí vývoj antivirových léčiv a vakcín proti stávajícím endemickým virům, jako je hepatitida, HIV, nachlazení a Covid-19, jakož i pro nové a emergingové pandemické hrozby.

Databáze, která byla nedávno detailní v časopise Biologie molekulárních systémůjiž odhalil některé dříve neznámé informace o genetickém předku SARS-CoV-2, viru zodpovědném za Covid-19.

Data z Viro3D naznačují, že klíčový protein v SARS-CoV-2, jeden z těch zodpovědných za infekci, může původně pocházet z genetické výměny s předchozím herpesvirem, rodinou virů zodpovědných za řadu nemocí včetně studených bolách a chicáků.

Výzkumný tým tvrdí, že Viro3d má potenciál generovat mnohem více informací, jako je tento – na Evoluční historie a původ virů – pro tisíce různých proteinů, pomáhající přejít na naše chápání virů lidských a zvířat a zase naše schopnost je bojovat testem.

Dr. Joe Grove, hlavní autor MRC-University Glasgow Center for Virus Research, řekl: „Jsme teprve na začátku porozumění obrovské genetické rozmanitosti uvnitř virové komunity. Viry jsou stejně staré jako celulární život, protože byly kolem miliard let.

„Viro3d poskytuje zcela nový pohled na viry, což nám umožňuje dozvědět se o jejich původu a evoluci. Očekáváme Viro3D a Umělá inteligenceZrychlit výpočetní návrh antivirových léčiv a vakcín proti stávajícím endemickým virům. Poté můžeme tyto návrhy vrátit zpět do laboratoří a poté do skutečného světa. “

Proteiny jsou stavebními kameny života, provádějí obrovskou škálu funkcí pro naše buňky a hrají kritické role ve zdraví i nemoci. Abychom pochopili, jak proteiny fungují, musí být vědci schopni prozkoumat svou trojrozměrnou strukturu.

Zatímco pokroky v umělé inteligenci vedly k vytvoření databází obecných proteinových struktur, jako je databáze Alphafold a evoluční měřítko modelování metagenomického atlasu, virové proteiny byly dosud buď vyloučeny z predikčního úsilí nebo zahrnuty pouze v malém počtu.