Amyotrofní laterální skleróza (ALS) je onemocnění, které ničí nervy nezbytné pro pohyb. Ovlivněno je asi 30 000 lidí ve Spojených státech a lékaři stále nevědí, co to způsobuje. Pro položení základu pro lepší testy, vědci Thomas Jefferson University Phillipe Loher, Eric Londin, PhD a Isidore Rigoutsos, PhD využívají přístup výpočetní biologie, aby viděli, jak ALS ovlivňuje molekuly v krvi.
Ve studii zveřejněné ve Molekulární neurobiologieTým analyzoval vzorky krve od asi 300 lidí s ALS a bez ALS. Výzkum se zaměřil na malé nekódující RNA (sncRNA), krátké molekuly, které pomáhají regulovat expresi genu a další důležité buněčné procesy. Minulá práce od Dr. Rigoutsose a jeho týmu v Jefferson Computational Medicine Center ukázala, že Parkinsonova choroba ovlivnila hladiny sncrny v krvi. Dr. Rigoutsos chtěl zjistit, zda to platí i pro ALS.
Tým zjistil, že lidé s ALS měli různé kombinace sncRNA ve srovnání s lidmi bez a některé sncrnas byly dokonce spojeny s tím, jak dlouho člověk po diagnostice žil.
Je zajímavé, že analýzy také odhalily některé sncRNA, které nepatřily do lidského genomu.
„Mnoho molekul, které se mění s nemocí, pochází z bakterií nebo hub,“ řekl Dr. Rigoutsos. Zatímco tým neví, zda jsou tyto změny příčinou nebo účinkem ALS, výsledky ukazují na mikrobiom hraní důležité role ve stavu.
Dr. RigOutsos říká, že výpočetní biologický přístup, který analyzuje obrovské množství dat pro nalezení skrytých vzorců sncRNA, bude klíčem pro pochopení neurodegenerativních onemocnění, jako je ALS, a vytváření lepší diagnostiky a prognostiky pro přesnější doby přežití.
„Můžeme dělat testy na počítači, které by trvalo mnoho měsíců, ne -li roky, v laboratoři,“ řekl. „Přesahuje to druhy věcí, které člověk může udělat jednoduše tím, že se podívá na tabulku.“
Zdroj:
